Первые метеорологические наблюдения начались в городе Кострома в 1842 году и проводились частными лицами- любителями природы. Так было до 1869 года. Затем наблюдения были прерваны и возобновлены лишь в 1883 году. Была организована метеорологическая станция при реальном училище, которая располагалась в западной части города и просуществовала до 1911 года. В 1913 году губернская земская управа вновь открыла метеостанцию в восточной части города. Летом 1920 года она была перенесена из города на опытное поле (на 3 км юго-восточнее прежнего места). Осенью 1921г. наблюдения на опытном поле прекратились, и станция перестала существовать. Однако летом 1922 г. Костромское научное общество организовало метеостанцию в центре города. С этого времени метеорологические наблюдения в Костром не прерывались, но местоположение станции менялось несколько раз. В июне 1924 года она была перенесена из города на правый берег Волги (д.Малышково) на восточную окраину старого парка, а в мае 1936 года ее переместили на 550 метров к западу в поле.

Для микроклиматической оценки проводились специальные синхронные наблюдения в нескольких точках города с октября 1974 г. по октябрь 1975 г. Пункты наблюдения выбирались с учетом особенностей рельефа и застройки, а также необходимости изучения микроклимата парковых и лесных массивов, расположенных внутри города и в его окрестностях.

В связи с интенсивной застройкой микрорайона Малышково в 1992 станция была перенесена в д.Коряково, где и находится в настоящее время.